Chromosomová genomika Agropyron cristatum, planého příbuzného pšenice seté

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-16992S

Název projektu anglicky

Chromosome genomics of Agropyron cristatum, a wild relative of wheat

Anotace anglicky

Wild species exhibit large genetic variation and are potential sources of novel genes for crop improvement. However, alien gene transfer is hampered by poor knowledge of chromosome and genome structure and the lack of methods for high-throughput and sensitive identification of alien chromatin. This project will provide novel insights into the genome organization of a wild relative of wheat, Agropyron cristatum, and develop knowledge and molecular tools to unlock its potential for wheat improvement. NGS sequencing chromosomes flow-sorted from cytogenetic stocks will unravel molecular organization of individual chromosomes and establish their virtual gene order maps. This will provide access to the gene set of the important wheat relative, facilitate rapid mapping of important traits, and enable detailed comparative analysis of chromosome structure and evolution within Poaceae. The expected results will be relevant to the academic and fundamental research on plant genome evolution and speciation as well as to pre-breeding and breeding programs in wheat relying on alien gene transfer.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt přinesl nové poznatky v oblasti strukturní genomiky Agropyron cristatum, které mohou být využity při šlechtění pšenice. Plánované cíle byly splněny, zpráva je přehledná a vztahuje se k jednotlivým cílům projektu. Výstupem jsou tři publikace v kvalitních časopisech (TAG, Plant Genome). Finanční prostředky byly čerpány ve schválené struktuře a výši a byly vynaloženy účelně.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

22. 7. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

5 026 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 267 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

759 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč