Funkce UPF1 helikázy v procesech odehrávajících se v buněčném jádře

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-18578S

Název projektu anglicky

Investigation of non-canonical function(s) of the UPF1 helicase

Anotace anglicky

Nonsense mediated RNA decay (NMD) is RNA quality control pathway removing aberrant mRNAs. While we have good biochemical insights into NMD mechanism, biological role(s) of NMD-proteins are still not fully understood. Several studies indicate that some NMD factors acquired additional cellular functions beyond the ones in NMD. However, functional analysis of these proteins is hindered by ensuing lethality upon inactivation in majority of organisms. Here we want to decipher non-canonical functions of UPF1, the key orchestrator of NMD, in Arabidopsis thaliana. We will take advantage of viable Arabidopsis UPF1-null mutants to investigate impact of UPF1 deficiency on chromatin structure, transposon activation, telomere function, genome stability and cell cycle progression. Furthermore, we will determine whether UPF1 associates with Arabidopsis chromatin and investigate functions of UPF1 helicase and ATPase activities. Since Arabidopsis UPF1 shares a high degree of identity with human UPF1, knowledge gained within this project will also be applicable to other eukaryotes including human.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt zkoumal nové biologické aspekty degradace mRNA se zaměřením na nekanonické funkce RNA helikázy UPF1. Řešení probíhalo v soulady s pravidly GAČR, všechny deklarované cíle byly splněny a výstupy projektu tvoří 4 původní práce ve velmi kvalitních impaktovaných časopisech včetně prestižního Plant Cell.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

11. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

7 366 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 366 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč