Molekulární fylogeneze Glomeromycota: od virtuálních taxonů k fylogeneticky vymezeným druhům a globální ekologii a biogeografii

Název projektu anglicky
Sequence-based phylogeny of Glomeromycota: from virtual taxa to phylospecies and global ecological and biogeographical patterns
Anotace anglicky
Arbuscular mycorrhizal fungi (AMF, Glomeromycota) are ecologically and agronomically important, but global data on their species abundance and diversity are scarce. From ~250 morphologically described AMF species only a small part is sequenced or available in culture collections, due to their obligate symbiotic lifestyle. The amount of ‘taxa’ based on environmental DNA sequences largely exceeds the number of described species. Thus, research is needed to further define the AMF species on the molecular level and to understand their genetic variability. We aim to implement new AMF sequence data into the curated database MaarjAM: namely the almost complete rDNA spanning the SSU, the complete ITS region and a large part of the LSU (~2.5 kb) from AMF generic type material and selected AMF species-rich field samples. This will enable us to determine bioinformatic thresholds for data analyses at different taxon levels, to conduct robust phylogenies, compare results of AMF community studies targeting different rDNA regions and to investigate their global ecological patterns and diversity.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EH - Ekologie – společenstva
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-GA0-GA-R/13:1
Datum dodání záznamu
22. 2. 2021

Podobné projekty(10)