Molekulární podstata evolučních přeměn telomer u rostlin řádu Asparagales

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-09644S

Název projektu anglicky

Molecular nature of evolutionary telomere transitions in Asparagales plants

Anotace anglicky

In 2016, we identified unusual telomeres in Allium plants. Together with our earliear results, it is clear now that two telomere switches occurred in evolution of Asparagales plant order: in the first, associated with divergence of Iris genus, typical plant telomeres (TTTAGGG)n were replaced with vertebrate-type (TTAGGG)n telomeres. The second switch - from (TTAGGG)n to (CTCGGTTATGGG)n - occurred during divergence of Allium genus. We aim to identify molecular principles of the transitions - changes in telomerase RNA subunits (TRs) and their interactions with catalytic subunits - and evaluate impact of the changes on nucleoprotein composition and functions of telomeres which largely depend on telomere-binding proteins (TBPs). RNA-Seq data will be generated from telomerase-enriched fractions and from whole transcriptomes to identify TRs and TBPs, respectively. Protein interactions with current and ancestral telomere DNA will be tested quantitatively. The project will improve understanding of structure-function relationships in telomeres and role of telomeres in speciation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl zaměřen na objasnění molekulárních mechanismů evolučních změn telomer prostřednictvím charakterizace telomerasových RNA podjednotek v široké škále vyšších rostlin. Telomerasové RNA vykazují značnou variabilitu, zatímco je struktura ortologních proteinů vázajících se na telomery poměrně konzervativní. Byly vyhodnoceny důsledky specifické struktury komplexů pro funkce telomeras.

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 4. 2019

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

23. 7. 2020

Celkové uznané náklady

10 203 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 000 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 203 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč