Polymorfní G-quadruplexy v promotorových oblastech genů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-12075S

Název projektu anglicky

Polymorphic G-quadruplexes in gene promoters

Anotace anglicky

G-quadruplexes (G4) are tetraplex DNA structures. G4 forming sequences are abundant in human genome. G4s are notably overrepresented in promoter regions of genes. G4 forming sequences from the promoter regions contributing to transcriptional regulation are arguably the most studied group of DNA regulatory elements nowadays. Targeting of regulatory G4 motifs using small molecular weight compounds to modulate expression levels of oncogenes emerges as a novel anti-cancer strategy. The G4 motifs are generally marked structural polymorphism manifested by coexistence of several G4 conformations; individual G4 structures in the polymorphic mixture have different populations as result of their distinct thermodynamic stabilities and/or differences in kinetics of their formation. While all these properties are inherent features of the conformational space for given G4 forming sequence, not all of them are necessarily important for their function in vivo. Our ability to identify G4 properties critical for its function is prerequisite for rational development of G4-specific drugs.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt se zabýval charakteristikou strukturních parametrů G-kvadruplexů DNA, jejich biologickou funkcí a identifikací vazebných proteinů. Projekt vyústil celkem do pěti velice kvalitních publikací a dvou knižních kapitol a přinesl zcela nové informace o těchto široce zastoupených genomových motivech.

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

7. 5. 2019

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

23. 7. 2020

Celkové uznané náklady

10 826 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 812 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 014 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč