Dynamika repetitivních sekvencí v raných stadiích evoluce apomiktických rostlin

Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Hlavní účastníci
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-14620S

Název projektu anglicky
Repeatome dynamics in the earliest evolutionary stages of apomictic plants
Anotace anglicky
Apomixis is tightly connected with hybridization and polyploidization. Despite a great potential in agriculture, the genetic mechanisms of apomixis are still poorly understood. Hybridization causes genetic instability including a restructuring of the repeatome, the fastest evolving part of plant genomes. Bursts of transposable elements due to hybridization-induced genomic shock may trigger a switch to apomixis. We will use sexual and apomictic parental Hieracium species in an extensive breeding program and compare artificial hybrids with natural apomicts of the same parentage / morphology as a model of hybrid speciation that may lead to the formation of apomictic lineages. Reproductive modes will be determined by flow cytometry, emasculation experiments and cytoembryological methods. We will analyze the repeatome by Next Generation Sequencing and use parental-specific repeats as cytogenetic markers to investigate genome repatterning following hybridization. The project will contribute to an understanding of mechanisms underlying the transition from sexual to apomictic reproduction.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EF - Botanika
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt se zabýval analýzou repetitivních sekvencí u diploidních pohlavně se rozmnožujících druhů jestřábníku, jakož i u apomiktických alopolyploidů. Pozornost byla rovněž věnována hybridům pohlavně se množících druhů a nově vzniklým triploidům.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Datum dodání záznamu
23. 7. 2020

Podobné projekty(10)