Genomika a populační genetika v systému parazit-hostitel: přeskoky, diverzifikace a adaptace
Cíle projektu
Projekt se věnuje problematice hostitelské specifity a genetické diverzifikace v interakci hostitel-parazit, na základě našich výsledků získaných pomocí modelu myšic rodu Apodemus a jejich parazitů, vší rodu Polyplax a protozoí rodu Eimeria. Cílem je objasnit některé neobvyklé situace, pozorované ve studovaných populacích. U vší Polyplax je nejzajímavějším zjištěním striktní geografické oddělení dvou geneticky charakterizovaných populací, pocházejících z odlišných refugií, přičemž hostitelé těchto populací prošli výrazným genetickým míšením a jejich areály se překrývají v podstatné části Evropy. Kromě klasických teorií populační genetiky se budeme věnovat roli symbiotických bakterií jako možných původců genetické bariéry. Pro eimerie je nejvýraznějším případem rozporu mezi evoluční historií hostitele a parazita ztráta původní linie eimerií u druhu A.agrarius a druhotný zisk eimerií od skupiny A.flavicollis/sylvaticus. Tento přeskok proběhl velmi rychle a „přenesené haplotypy“ zcela vymizely z původních hostitelů. V projektu budeme zkoumat evoluční procesy podmiňující tyto změny.
Klíčová slova
genomicsphylogeneticspopulation geneticsparasitismsymbiosisadaptation
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Hlavní účastníci
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-19831S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Genomics and population genetics in host-parasite system: switches, diversification and adaptation
Anotace anglicky
The project approaches a topic of host-specifcity and genetic diversification in host-parasite interface, directed by our recent observations on the field mice Apodemus and their parasites, lice of the genus Polyplax and protozoans of the genus Eimeria. We aim at explaining the remarkable patterns found in the previously investigated populations. For Polyplax, the main puzzle is strict geographic split between two genetically determined populations, originated in different refugia, with their hosts already mixed across substantial part of Europe. Apart from the classical population genetic theories, we will explore possible role of Polyplax-housed symbiont as an inter population barrier. In Eimerie, the most remarkable discrepancy between the host and parasite histories is manifested by the loss of autochtonous eimerians in A. agrarius and multiple acquisitions of eimeria from A.flavicollis/sylvaticus group. This switch happened rapidly and the “switched haplotypes” abandoned entirely their original hosts. The project intends to explore the evolutionary processes behind these events.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EG - Zoologie
CEP - vedlejší obor
EH - Ekologie – společenstva
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10613 - Zoology
10614 - Behavioral sciences biology
10615 - Ornithology
10616 - Entomology
10618 - Ecology
10619 - Biodiversity conservation
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2017
Ukončení řešení
31. 12. 2021
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
26. 4. 2019
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-GA0-GA-R/11:1
Datum dodání záznamu
22. 2. 2021
Finance
Celkové uznané náklady
8 863 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
8 567 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
296 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
8 863 tis. Kč
Statní podpora
8 567 tis. Kč
96%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EG - Zoologie
Doba řešení
01. 01. 2017 - 31. 12. 2021