Funkční charakterizace receptorů pro ptačí sarkomové a leukozové viry
Cíle projektu
Ptačí sarkomové a leukózové viry (ASLV, Avian sarcoma and leukosis viruses) jsou hospodářsky významné retroviry vyvolávající nádorová onemocnění kuřat. Bylo popsáno 6 podkupin ASLV (A-E a J) rozlišených podle využití vstupních receptorů TVA, TVB. TVC a TVJ. Nefunkční resistenční receptorové alely byly vyselektovány během evoluce, předpoklá se že pod tlakem virových infekcí. Na základě ortologie s lidským receptorem CD320 navrhujeme pokusy testující, zda TVA slouží jako kuřecí receptor pro import vitamínu B12 (kobalaminu). Dále určíme dopady této funkce na virovou infekci a virem navozený cytopatický efekt. Další experimenty budou zaměřeny na určení přirozeného ligandu pro TVB. Pomocí nově dostupných dat z ptačích genomů budeme charakterizovat resistenční alely TVA a TVB a na ně působící selekční tlaky. Dále se zaměříme na nově vznikající podskupiny ASLV. Pomocí virologických technik budeme charakterizovat nově vzniklou podksupinu K. Endogenní kuřecí retroviry slouží jako zdroj pro nové podkupiny ASLV. Navrujeme vytvoření veřejně dostupné databáze těchto retrovirových elementů.
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Hlavní účastníci
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-23675S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Functional characterization of Avian Sarcoma and Leukosis Virus receptors
Anotace anglicky
Avian sarcoma and leukosis viruses (ASLV) are economically important tumor-inducing retroviruses infecting chickens. Six ASLV subgroups, A-E and J, have been defined by differential usage of four receptors, TVA, TVB, TVC and TVJ, for their entry into cells. Nonfunctional resistance alleles of the chicken receptor genes have been selected during evolution presumably under the pressure of virus infections. Based on orthology with human CD320 receptor, we propose to test whether TVA serves as import receptor for vitamin B12 (cobalamin) in chicken. We will determine the functional consequences for virus infection and virus-induced cytopathic effect. We also plan to determine the natural ligand for TVB. Using the newly available genomic data from birds, we will characterize the evolutionary forces that generate the receptor resistance alleles of TVA and TVB. Lastly, we will focus on the newly emerging ASLV subgroups. We will virologically define the subgroup K and create a publicly available database of endogenous chicken retroviruses, which serve as source for new ASLV subgroups.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10606 - Microbiology
10607 - Virology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2017
Ukončení řešení
31. 12. 2021
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
10. 4. 2019
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-GA0-GA-R/13:1
Datum dodání záznamu
22. 2. 2021
Finance
Celkové uznané náklady
6 819 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 261 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
558 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
6 819 tis. Kč
Statní podpora
6 261 tis. Kč
91%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EE - Mikrobiologie, virologie
Doba řešení
01. 01. 2017 - 31. 12. 2021