Zapojení telomerázy do buněčného interaktomu
Cíle projektu
V předchozím období jsme s využitím proteomických přístupů a cíleného prohledávání cDNA knihoven identifikovali pravděpodobné proteinové interakční partnery rostlinné telomerázy in vivo. Cílem navrhovaného projektu je objasnit vztah těchto proteinů k telomeráze u Arabidopsis thaliana v souvislosti s jejími telomerickými i netelomerickými funkcemi. Jedná se zejména o proteiny s dosud neznámou funkcí, proto je dalším z dílčích cílů projektu detailní funkční charakterizace genů kódujících tyto proteiny a jejich biologické funkce nezávislé na telomeráze. Výsledky získané během řešení projektu významně obohatí obecné znalosti o interaktomu rostlinné telomerázy a přispějí ke zlepšení pochopení vztahu telomerázy k biologickým drahám, které v rostlinných modelech v souvislosti s telomerázou dosud nebyly zkoumány.
Klíčová slova
transcriptome analysisRNA-seqprotein-protein interactionsplant tissue-specific expressionreplicationDNA repairnon-telomeric functions of telomerase
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Hlavní účastníci
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
18-07027S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Involvement of telomerase in the cell interactome
Anotace anglicky
Using proteomic approaches and cDNA library screening we have identified recently proteins that may function as interaction partners of plant telomerase in vivo. We aim to elucidate their functional relationship with Arabidopsis telomerase and its telomeric and/or non-telomeric functions. These proteins have mostly unknown function thus another of our progressive goals is characterization of the genes encoding these proteins and of their telomerase-independent biological functions in detail. The project results will enhance the general knowledge about plant telomerase interactome and improve understanding of the telomerase involvement to biological pathways that have not been investigated yet in plant model systems in connection with telomerase
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - vedlejší obor
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - další vedlejší obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)CE - Biochemie
EA - Morfologické obory a cytologie
EB - Genetika a molekulární biologie
EF - Botanika
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt se zabýval podrobnou analýzou různých proteinů interagujících s rostlinnou telomerázou jak v rámci jejích telomerických, tak hlavně netelomerických funkcí. Jeho výsledkem je přehled desítek interagujících proteinů, z nichž některé byly analyzovány podrobněji. Na projektu se zúčastnila řada studentů různých stupňů vysoké školy. Výstupem projektu je 8 publikací v impaktovaných časopisech.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2018
Ukončení řešení
31. 12. 2021
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2021
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-GA0-GA-U
Datum dodání záznamu
29. 6. 2022
Finance
Celkové uznané náklady
12 531 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
11 628 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
903 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
12 531 tis. Kč
Statní podpora
11 628 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Plant sciences, botany
Doba řešení
01. 01. 2018 - 31. 12. 2021