Molekulární podstata Staufen zprostředkované funkce 3'UTR

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 22 (SGA0201800001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

18-08153S

Název projektu anglicky

Molecular basis of Staufen-mediated 3'UTR function

Anotace anglicky

The non-coding part of the genome vastly increased from worm to humans while the number of protein-coding genes remained constant. This expansion also includes the 3’UTRs of mRNAs with an average length of 1.2 kb in humans and functions in mRNA transport, translational control and mRNA decay. Despite the importance of 3’UTRs for spatial and temporal control of gene expression, the molecular basis of 3’UTR functions is largely unknown. We will determine complexes of 3’UTR signals with Staufen1 protein and the ribosome which regulate mRNA stability. Using integrative structural biology approaches, we will unravel the molecular basis of Staufen-mediated 3’UTR functions in posttranscriptional regulation of gene expression and thus provide new insights into how deregulation contributes to common diseases such as cancer and neurodegeneration.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V rámci projektu byly vyřešeny struktury komplexů Staufen1 dsRBD 3 a 4 s 3’UTR SMD sekvencí ARF1 mRNA (WP1). Cíle WP2 a WP3 byly naplněny částečně, nicméně se jednalo o značně ambiciózní a obtížné WP zaměřené na strukturní analýzu full-length dimeru Staufen1 a jeho interakcí s 3’ UTR a ribozomem. Získané výsledky by měly vést k dokončení těchto cílů v blízké budoucnosti.

Zahájení řešení

1. 1. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2021

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2021

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-GA0-GA-U

Datum dodání záznamu

29. 6. 2022

Celkové uznané náklady

11 281 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

11 081 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

195 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč