Vše
Vše

Co hledáte?

Vše
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Analýza reakčních sítí s omezujícími podmínkami - nástroj pro experimentální validaci modelů biochemických a fotobiologických reaktorů

Cíle projektu

Navrhovaný výzkum je zaměřen na dynamiku biochemických reakcí in vitro a in vivo zkoumaných z pohledu oscilací a jiných emergentních jevů, které vznikají prostřednictvím interakce podsystémů. Prvním typem zkoumaných systémů jsou oscilační biochemické reakce v míchaném reaktoru s cílem použít experimentálně zjištěné oscilace k identifikaci kinetických parametrů reakční sítě sloužící jako model systému. Navazujícím systémem jsou propojené biochemické reaktory, v nichž je emergentní jev (Turingova struktura) využit ke konstrukci logických funkcí na biochemickém základě. Hierarchicky nejsložitějším systémem jsou pak fotosyntetizující sinice ve fotobioreaktoru. Experimenálně pozorované metabolické/ultradiánní/cirkadiánní rytmy budou popsány modelem biochemické reakční sítě a původ oscilací bude zkoumán prostředky teorie stability reakčních sítí a bifurkační analýzou. Hlavními cíli jsou sestavení modelu ve formě reakční sítě, formulace metodiky a její aplikace na identifikaci kinetických parametrů při nichž model reprodukuje oscilace/rytmy v uvedených systémech.

Klíčová slova

reaction networks theoryenzyme/biochemical and biological processesoscillatory dynamicscircadian and metabolic rhythmsparameter estimationconvex optimizationexperimental validation of models

Veřejná podpora

  • Poskytovatel

    Grantová agentura České republiky

  • Program

    Standardní projekty

  • Veřejná soutěž

    Standardní projekty 22 (SGA0201800001)

  • Hlavní účastníci

    Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemicko-inženýrská

  • Druh soutěže

    VS - Veřejná soutěž

  • Číslo smlouvy

    18-24397S

Alternativní jazyk

  • Název projektu anglicky

    Constrained analysis of reaction networks - a tool for experimental validation of models of biochemical and photobiological reactors

  • Anotace anglicky

    Proposed research is focused on dynamics of biochemical reactions in vitro and in vivo examined from the viewpoint of oscillations and other emergent phenomena occurring through interaction of subsystems. The first system is oscillatory biochemical reactions in a stirred reactor with the aim of using experimentally found oscillations to identify kinetic parameters of the model reaction network. The second type is coupled enzyme reactors where the emergent phenomenon (Turing structure) is used in constructing logic functions on biochemical basis. Hierarchically most complex is the system of photosynthesizing cyanobacteria in a photobioreactor. Experimentally observed metabolic/ultradian/circadian rhythms will be described as biochemical reaction networks and origin of oscillations will be examined using stability theory of reaction networks and bifurcation analysis. The main goals are to construct reaction network models, formulation of methodology and its applications for identification of kinetic parameters at which the model reproduces the observed oscillations/rhythms.

Vědní obory

  • Kategorie VaV

    ZV - Základní výzkum

  • OECD FORD - hlavní obor

    20401 - Chemical engineering (plants, products)

  • OECD FORD - vedlejší obor

  • OECD FORD - další vedlejší obor

  • CEP - odpovídající obory
    (dle převodníku)

    CI - Průmyslová chemie a chemické inženýrství

Termíny řešení

  • Zahájení řešení

    1. 1. 2018

  • Ukončení řešení

    31. 12. 2021

  • Poslední stav řešení

  • Poslední uvolnění podpory

    24. 4. 2020

Dodání dat do CEP

  • Důvěrnost údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Systémové označení dodávky dat

    CEP21-GA0-GA-R/10:1

  • Datum dodání záznamu

    22. 2. 2021

Finance

  • Celkové uznané náklady

    8 101 tis. Kč

  • Výše podpory ze státního rozpočtu

    7 240 tis. Kč

  • Ostatní veřejné zdroje financování

    771 tis. Kč

  • Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

    90 tis. Kč

Základní informace

Uznané náklady

8 101 tis. Kč

Statní podpora

7 240 tis. Kč

89%


Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

OECD FORD

Chemical engineering (plants, products)

Doba řešení

01. 01. 2018 - 31. 12. 2021