Ekologická speciace generalistického organismu: populačně-genomická analýza adaptací a biogeografie tasemnice Ligula intestinalis

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 23 (SGA0201900001)

Hlavní účastníci

Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

19-04676S

Název projektu anglicky

Ecological speciation of a generalist organism: population genomics of adaptation and biogeography of Ligula intestinalis tapeworms

Anotace anglicky

Emergence of ecological adaptations in sympatric populations and their impact on genetic diversification and formation of new species represent long-discussed topics in evolutionary biology. The emergence of new methods allowing to study genomic differentiation on the level of populations provided valuable insights, but also introduced several controversies (e.g. by finding intrinsic genomic processes producing similar genetic outcomes to ecological speciation). Thus, new speciation models are required to test the hypothesis of ecological speciation. Due to their clear ecological definition, parasites represent such a model, allowing to test the role of host specificity as a driver of ecological speciation. The proposed study will address speciation questions by generating a high-quality genome of the tapeworm Ligula intestinalis, a globally distributed parasite with wide host spectrum. Genome will be then complemented with a genetic map allowing analysis of both the intrinsic genomic processes and adaptations associated with host switches and evolution of new lineages in parasites.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EA - Morfologické obory a cytologie

Zahájení řešení

1. 1. 2019

Ukončení řešení

30. 6. 2022

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2022

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP23-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

26. 6. 2023

Celkové uznané náklady

6 635 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 575 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

60 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč