Genomika replikované diverzifikace cichlid v říčních systémech: Vliv hybridizace na adaptivní radiaci u neotropického rodu Crenicichla
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 23 (SGA0201900001)
Hlavní účastníci
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
19-20012S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Genomics of replicated cichlid diversification in rivers: The role of hybridization in adaptive radiation of Neotropical pike cichlids (Crenicichla)
Anotace anglicky
In this project we will study the role of hybridization in adaptive radiation of Neotropical pike cichlids (Crenicichla). Our unique model of two not closely related riverine species flocks with five analogous ecomorphs evolved by replicated diversification and representing distinct trophic roles will be used. Based on whole genome sequencing of 250 individuals we will analyze introgressive gene flow to distinguish between causative hybridizations sensu syngameon or hybrid swarm origin hypotheses, recent introgressions and ancestral polymorphism. We will also search for specific genomic regions of high differentiation ("genomic islands of speciation") that could be a signature of diversifying selection. To achieve full employment of the WGS data we will sequence and assemble a reference genome of an appropriate congeneric species.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10613 - Zoology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EG - Zoologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2019
Ukončení řešení
30. 6. 2022
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
26. 6. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
7 832 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
7 832 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč