Klíčové mutace v nádorovém genomu Nothobranchius furzeri: od nádorové biologie k návrhu experimentálního modelu sporadické kancerogeneze

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 23 (SGA0201900001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

19-20873S

Název projektu anglicky

Driver mutations in cancer genome of Nothobranchius furzeri: from tumor biology to concept of experimental model of spontaneous carcinogenesis

Anotace anglicky

African annual killifish Nothobranchius furzeri is an established model species in many fields of research with special emphasis on aging. It is extremely short-lived species that recapitulate standard vertebrate ageing and display spontaneous age-dependent carcinogenesis, an exceptional feature among vertebrates. In pilot experiment with highly inbred and extremely short-lived strain, we confirmed incidence of liver and kidney neoplasia. Our preliminary data from whole exome sequencing indicate that there is considerable number of mutations in genes related to the processes involved in malignant transformation. The aim of the project is to determine driver mutations in tumor suppressor genes and oncogenes and define their role in kidney and liver carcinogenesis. To detect and characterize driver mutations accompanying malignant transformation whole genome sequencing and bioinformatics approaches will be employed. Selected drivers will be evaluated by in vivo CRISPR/Cas9 mutagenesis and N. furzeri proposed as a model of spontaneous (sporadic) carcinogenesis in biomedical research.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2019

Ukončení řešení

31. 12. 2023

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

30. 4. 2021

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

22. 2. 2022

Celkové uznané náklady

8 311 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 774 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

537 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč