Využití ionizací v plynné fázi za atmosferického tlaku pro hmotnostní spektrometrii peptidů
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202000001
Hlavní účastníci
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-09126S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
The utility of atmospheric pressure gas-phase ionizations in mass spectrometry of peptides
Anotace anglicky
Mass spectrometry (MS) with electrospray ionization (ESI) is a prominent technology in proteomics. When coupled to chromatography, it allows for the identification and quantification of thousands of proteins in biological samples. However, this approach has limitations. An important portion of peptides remains undetected mainly because of ion suppression effects taking place in ESI, which lowers sequence coverage values and the number of detected proteins. We propose to use gas-phase ionizations as complementary methods to ESI. Atmospheric pressure chemical ionization (APCI) and photoionization (APPI) are commonly used in MS. Peptides are considered incompatible with them, despite the fact that certain peptides can be detected even more sensitively than in ESI. In this project, we will explore the applicability of APCI and APPI for MS of peptides. We propose derivatization of peptides to increase their hydrophobicity and thus detectability in APCI and APPI. To make these ionizations available at low sample flow rates used in proteomics, a dedicated ion source will be developed.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CB - Analytická chemie, separace
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2020
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
8. 4. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
26. 6. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
5 179 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
4 039 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 101 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč