Molekulární mechanismy nekanonických 3' terminálních modifikací RNA a jejich úloha v metabolismu kódujících a nekódujících RNA
Cíle projektu
Eukaryotické RNA prochází řadou posttranskripčních úprav jako jsou například interní modifikace či extenze nekódovanými nukleotidy na 3' koncích. Uridylace na 3' koncích RNA má v RNA metabolismu různé funkce. Účastní se jak produkce funkčních RNA tak RNA degradace. Na úrovni celého organismu má uridylace klíčovou úlohu ve tvorbě zárodečných buněk a v časném vývoji a diferenciaci. Poruchy v uridylaci byly spojeny s řadou lidských onemocnění. My jsme nedávno odhalili evolučně konzervovanou dráhu pro kontrolu kvality RNA, v níž jsou vadné RNA uridylovány a po té degradovány nukleázou DIS3L2. V tomto projektu budeme studovat molekulární principy rozpoznání špatných RNA, jak jejich stabilita ovlivňuje genovou expresi a zaměříme se na odhalení dalších faktorů důležitých pro tuto dráhu. Věříme, že tyto nové poznatky pomohou k pochopení jak se poruchy v uridylaci a DIS3L2 vztahují k některým lidským onemocněním.
Klíčová slova
RNA processinguridylationpolyadenylationDIS3L2exoribonucleaseRNA surveillancencPAPTUTase
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202000001
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-19617S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
The molecular mechanisms of noncanonical 3' terminal RNA tailing and its role in the metabolism of coding and noncoding RNAs
Anotace anglicky
Eukaryotic RNAs undergo a wide variety of posttranscriptional modifications, such as base modifications or nontemplated 3'-end tailing. The 3' terminal RNA uridylation plays diverse roles in RNA metabolism acting in both, production of functional RNAs and RNA decay. On organismal level, uridylation is essential for germline maturation and early development and differentiation. Defects have been linked to a number of human disseases. We have previously identified a conserved RNA quality control pathway that mediates degradation of aberrant forms of noncoding RNAs in the mammalian cytoplasm. It involves uridylation of aberrant RNAs, and their subsequent targeting by exoribonuclease DIS3L2. In this project we aim to further investigate the molecular principles of aberrant RNA recognition and targeting, how is RNA surveillance interlinked with gene expression regulation and finally identify additional factors involved in this pathway. We believe, that results of this work will help to understand how uridylation and DIS3L2 relate to the disease phenotypes.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)CE - Biochemie
EB - Genetika a molekulární biologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2020
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
8. 4. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
26. 6. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
10 824 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
10 806 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
18 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
10 824 tis. Kč
Statní podpora
10 806 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Biochemistry and molecular biology
Doba řešení
01. 01. 2020 - 31. 12. 2022