Konformační flexibilita peptidů v roztoku

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

202/07/0732

Název projektu anglicky

Conformational flexibility of peptides in solution

Anotace anglicky

The project aims at the dynamic aspects of peptide conformation in aqueous solution where peptide structural properties are most relevant to their biological role. In order to obtain solid physical knowledge about peptide structure and dynamics, we willproceed from simple model dipeptides to more complex systems. Experimentally the project is based mainly on Raman Optical Activity (ROA) and Raman scattering that can sense equilibrium distributions of rapidly fluctuating structures with parallel NMR experiments. Interpretation of Raman and ROA spectra will be based on advanced spectral simulations taking into account conformational flexibility of the studied systems as well as solvent effects. Potential energy surface will be mapped for simple models to get realistic estimates of their flexibility. Force fields and polarizability tensors of longer peptides will be constructed from short fragments by means of atomic tensor transfer. The ultimate goal is to fill the gap between knowledge about

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

BO - Biofyzika

CEP - vedlejší obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry<br>10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Výsledky projektu přispěly k rozšíření aplikace Ramanovy optické aktivity do fyziky biomolekul především ve vysokofrekvenční oblasti, kde leží valeční vibrace vodíku. Tímto se dosud nikdo systematicky nezabýval. Projekt zároveň přispěl k rozvoji metod s?

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

22. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-GA0-GA-U/02:2

Datum dodání záznamu

22. 1. 2015

Celkové uznané náklady

3 069 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 069 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč