Studium konformace bílkovin pomocí hmotnostní spektrometrie na principu MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation - Time Of Flight)

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Application of MALDI-TOF (matrix assisted laser desorption ionisation - Time of Flight) mass spectrometry on the determination of protein conformation

Anotace anglicky

In the course of this year (2001) we have purchased a mass spectrometer working on MALDI-TOF principle (Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation - Time Of Flight). The aim of this project is to construct a panel of methods allowing the application ofthis method on the study of proteins' conformation. For several decades a number of methods has been known that allow to modify covalently reactive groups localised on the surface of protein molecules (amino groups, side chains of Tyr, Trp, His, Cys etc.) under non-denaturing conditions. After the modification and cleavage of the protein by trypsin (or some other standard method), surface reactive groups should be identified by mass spectrometry. Bifunctional reagents can also be used that connect two reactive groups; their relative distance can be determined with certain accuracy. This methodology can be employed for any globular protein in solution; we are going to use it together with traditional spectroscopic methods for the study of an

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly zavedeny metody, umožňující specificky modifikovat postranní řetězce některých aminokyselin (lysin, tryptofan, tyrosin) a tyto modifikace identifikovat pomocí hmotnostní spektrometrie.Analysou výsledků modifikací modelových proteinů o známé prostoro

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2004

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7

Datum dodání záznamu

2. 6. 2008

Celkové uznané náklady

2 060 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 020 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 040 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč