Implementace iTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation) pro kvantifikaci integrálních membránových bílkovin z rostlinných buněk

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

203/09/0036

Název projektu anglicky

Implementation of iTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation) for quantification of integral membrane proteins from plant cells

Anotace anglicky

Integral membrane proteins play key roles in the number of cellular processes. Thus knowledge of their expression levels under different physiological and/or pathological conditions is essential for determination of relevant biological questions. Quantification of the integral membrane proteins represent an analytical challenge due to problems resulting predominantly from extreme hydrophobicity of their transmembrane domains. Recently, promising approaches, aspiring to use mass spectrometry for quantification of proteins, emerged. Among them it seems to be very perspective the method called iTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation). The goal of the presented project is full implementation of iTRAQ technique for analysis of very complex mixtures of integral membrane proteins isolated from plant cells. Developed method will be subsequently applied for study of expression levels of integral plasma membrane proteins in Arabidopsis thaliana suspension cells.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

CB - Analytická chemie, separace

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)

10406 - Analytical chemistry
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu proběhlo podle plánu jak z hlediska odborného tak i z hlediska čerpání finančních prostředků.

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2011

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2011

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP12-GA0-GA-U/02:2

Datum dodání záznamu

2. 5. 2016

Celkové uznané náklady

2 743 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 743 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč