Superrychlé mapování genomu a analýza sekvencí DNA pulzní elektroforézou v krátkých kapilárách

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav analytické chemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

—

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Ultrafast genome mapping and DNA sequence analysis by pulsed field electrophoresis in short capillaries

Anotace anglicky

The overall goal of the project is to develop the method of pulsed-field electrophoresis in short capillaries as a routine technology for ultrafast diagnostic DNA sequencing and for analysis of megabase-size restriction fragments of a genomic DNA. We were inspired to the introduction of short capillaries by our previous observation of high separation power at the free electrolyte - polymer solution interface. Our project involves also an attempt to realize a separation of biopolymers on a solid and/or liquid polymer membrane. It follows from our preliminary separations in short capilaries held at an elevated temperature that a sequence up to 300 bases (reasonable for diagnostic sequencing) can be determined in three minutes. Further improvement in thelength of sequence reading in capillaries is expected as a result of an application of pulsing field. Pulsed-field capillary electrophoresis will also be used in the genetic research of bateriophages and pathogenic bacteria. This technique enable us to e

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

CB - Analytická chemie, separace

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10406 - Analytical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Kapilární elektroforéza v pulzním poli představuje v současné době jednu z nejvyužívanějších metodik i ve srovnání se světem. Mapování genomu rovněž je předmětem zájmu všech vyspělých zemí, a proto je možno hodnotit výsledky tohoto projektu za velmi dobr

Zahájení řešení

1. 1. 1997

Ukončení řešení

1. 1. 1999

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2000/GA0/GA00GA/U/6:2

Datum dodání záznamu

—

Celkové uznané náklady

2 465 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 650 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč