Úloha cytoskeletálních interakcí translačního iniciačního faktoru eIF3 v morfogenezi kvasinek
Cíle projektu
Esenciální gen RPG1/TIF32 kvasinky Saccharomyces cerevisiae kóduje velkou podjednotku translačního iniciačního faktoru eIF3. Zjistili jsme, že kromě interakcí s jinými podjednotkami eIF3 Rpg1p lokalizuje na mikrotubuly a fyzicky interaguje s aktin-asociovaným proteinem Sla2. V tomto projektu navrhujeme pokračování funkční analýzy cytoskeletárních interakci Rpg1p a celého eIF3 komplexu. S využitím moderních technik kvasinkové molekulární buněčné biologie budeme ověřovat hypotézu, že Rpg1p je proteinem propojujícím komplex eIF3 s cytoskeletem. Navrhované experimenty zahrnují kompletní analýzu Rpg1p interakcí, konstrukci intragenově značených delečních derivátů Rpg1p a jeho interakčních partnerů, konstrukci nových rpg1 mutantů a jejich fenotypickou analýzu, kolokalizaci Rpg1p s interakčními partnery a objasnění vlivu fosforylace na distribuci Rpg1p. Jelikož lidský ortolog Rpg1p, protein p170, patří mezi významné markery zhoubného bujení, předpokládáme, že také naše výsledky by měly
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Role of cytoskeletal interactions of the translation initiation factor eIF3 in yeast morphogenesis
Anotace anglicky
The essential gene RPG1/TIF32 of Saccharomyces cerevisiae encodes the large subunit of the translation initiation factor eIF3. We found that besides the interactions with other eIF3 subunits it localizes to microtubules and physically interacts with theactin-associated protein Sla2. In this project we propose to continue the functional analysis of the cytoskeletal interactions of Rpg1p and the eIF3 complex. With the use of modern techniques of the yeast molecular cell biology we will explore a hypothesis that Rpg1 is the eIF3-cytoskeleton bridging protein. The experiments suggested would include a complete analysis of Rpg1p interactions, constructions of intragenously tagged deletion derivatives of Rpg1p and Rpg1p-interacting proteins, constructions of new rpg1 mutants and their phenotypic analysis, co-localizations of Rpg1p with interacting partners and elucidation of the effect of Rpg1p phosphorylation on its distribution. Since the human ortholog of Rpg1p, protein p170, appeared to
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
EA - Morfologické obory a cytologie
CEP - další vedlejší obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10606 - Microbiology
10607 - Virology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt se týkal objasnění úlohy cytoskeletálních interakcí translačního iniciačního faktoru eIF3a/Rpg1 v morfogenezi S.cerevisiae. Důležité bylo zejména naše zjištění, že morfologické aberace hostitelského kmene nadprodukujícího S.pombe homologa eIF3a j
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2002
Ukončení řešení
1. 1. 2004
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Datum dodání záznamu
2. 6. 2008
Finance
Celkové uznané náklady
3 817 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 770 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 047 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
3 817 tis. Kč
Statní podpora
2 770 tis. Kč
72%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2002 - 01. 01. 2004