Porovnání vlivu rostlinných forminů třídy I a II na dynamiku aktinového cytoskeletu
Cíle projektu
Nevýrazný fenotyp rostlinných mutantů s porušeným Arp2/3 komplexem naznačuje, že rostliny využívají alternativní mechanismus nukleace F-aktinu. Forminy (FH2 proteiny) vykazují aktin-nukleační aktivitu u kvasinek a živočichů, a letos byla publikována první práce naznačující obdobnou funkci u rostlin. Naše bioinformatická analýza odhalila významné rozdíly mezi dvěmi třídami rostlinných forminů. Většina forminů třídy I má na N-konci transmembránovou doménu, avšak chybí jim konzervativní lysinový zbytek, ukvasinkového Bni1p nezbytný pro nukleaci aktinu; rozsáhlá inserce v této oblasti naznačuje alternativní uspořádání aktin-vazebného místa. Většina forminů třídy II odpovídá konsensu FH2; jejich asociaci s membránou by mohla zprostředkovat doménapodobná Pten, jedinečná pro rostliny. Budeme zkoumat vliv vybraných forminů obou tříd na dynamiku aktinového cytoskeletu in vivo, především za použití současné transientní exprese GFP-značených forminů a dsRed-značené aktin-vazebné domény fimbrinu jako
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
204/05/0268
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Comparison of class I vs. class II plant formins effects on the dynamics of actin cytoskeleton
Anotace anglicky
Weak phenotypes of plant mutants affecting the Arp2/3 actin-nucleating complex suggest that plants use an alternative mechanism for F-actin nucleation. Formins (FH2 proteins) can nucleate actin in yeast and metazoans, and first study suggesting a similarfunction in plant cells appeared this year. Our bioinformatic analysis revealed substantial differences between two classes of plant formins. Most Class I formins possess a N-terminal transmembrane domain but lack a conserved Lys residue essential for activity of yeast Bni1p; a large insertion in that area suggests an alternative construction of the actin-binding site. Most Class II formins correspond to the FH2 consensus and contain a plant-specific Pten-related domain that might mediate membrane association. We will study effects of representative members of both formin classes on the dynamics of actin cytoskeleton in vivo, using an approach based mostly on transient co-expression of GFP-formin fusion proteins and dsRed-tagged ABD of fimbrin as
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
EA - Morfologické obory a cytologie
CEP - další vedlejší obor
EF - Botanika
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Vzhledem k tomu, že v poslední době bylo jinými skupinami publikováno několik prací věnovaných rostlinným forminům třídy I, zaměřili jsme se především na chování vybraného zástupce dosud prakticky necharakterizované třídy II, totiž proteinu AtFH16 z Arab
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2005
Ukončení řešení
31. 12. 2007
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
2. 5. 2007
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Datum dodání záznamu
16. 12. 2008
Finance
Celkové uznané náklady
1 715 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 715 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
1 715 tis. Kč
Statní podpora
1 715 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2005 - 31. 12. 2007