Konstrukce a prozkoumání účinnějších genových bank z celkového genetického fondu (DNA, mRNA) mikrobiálních vzorků odebraných ze znečištěných lokalit

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

204/06/0458

Název projektu anglicky

Construction and exploration of more effective gene libraries comprising the total microbial environmental gene pool (DNA and mRNA) of polluted sites

Anotace anglicky

Samples from biofilters and contaminated soils will serve as sources of total microbial genetic material, which will be placed into environmental gene libraries. We will use three different methods for the construction of the gene libraries. (1) Total bacterial DNA will be inserted into a bacterial vector; (2) total eukaryotic DNA will be inserted into a shuttle vector; (3) total mRNA will be reverse transcribed into cDNA and inserted into an expression vector. The gene libraries will be screened in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae for the presence of novel enzymatic activities encoded by new pyranose oxidase and epoxide hydrolase genes. We will use substrates that are known to be not efficiently converted into products. The enzymatic activities will be characterised by HPLC, chiral gas chromatography, and mass spectrometry. The goal of the project is to work out new techniques for the construction of more effective gene libraries, using pyranose oxidases and epoxide hydrolases as

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EI - Biotechnologie a bionika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla vypracována nová účinná metoda na základě PCR pro získání neznámých epoxidhydrolas z metagenomu (celkové DNA izolované z půdních vzorků). Metagenom je považován za téměř nevyčerpatelný zdroj nových genů z neznámých a nekultivovatelných mikroorganism

Zahájení řešení

1. 1. 2006

Ukončení řešení

31. 12. 2008

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

25. 4. 2008

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP09-GA0-GA-U/02:2

Datum dodání záznamu

22. 10. 2009

Celkové uznané náklady

1 614 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 614 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč