Integrační preference retrovirů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

204/07/1030

Název projektu anglicky

Integration preference of retroviruses

Anotace anglicky

We have described by mapping of cloned integration sites that HIV-1 proviruses integrate preferentially into GC-rich genomic compartments with high gene density and into cytogenetic R bands. Furthermore, we sequenced 57 integration sites of Rous sarcomavirus (RSV) and mapped them on the chicken draft genome assembly. This would be interesting for the potential use of RSV as a gene vector and for comparison of genome evolution. One basic property of the chicken genome is the presence of microchromosomesand a high density of genes. Despite the significant methodological progress, there is still a need for reliable, unbiased and high throughput technique of integration site sequence analysis. We therefore suggest an alternative approach based on the ability of type II restriction endonucleases to cleave the target DNA several nucleotides downstream from their recognition sequence. Integration of a retrovirus with inserted restriction site at the very end of U5 segment of the 3´LTR enables the

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Postup řešení projektu a získané výsledky odpovídají původnímu záměru a odrážejí upřesnění plánu prací na jednotlivé roky v rámci DZ. Výstupy projektu jsou dvě publikace (jedna vyšlá v roce 2008, druhá doložená dodatečně zaslanou korekturou v březnu 201?

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

22. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-GA0-GA-U/02:2

Datum dodání záznamu

22. 1. 2015

Celkové uznané náklady

4 218 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 218 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč