Vliv shlukování makromolekul na strukturu a kinetiku enzymů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202100005

Hlavní účastníci

Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

21-15936S

Název projektu anglicky

Effects of Macromolecular Crowding on Enzyme Structure and Kinetics

Anotace anglicky

The cellular environment contains large amounts of macromolecules. None of them is present in high concentration, but overall, the environment is crowded, because macromolecules occupy about 40 % of the volume of the cells. Proteins are frequently studied in aqueous solutions without the presence of other macromolecules both in vitro and in silico. However, including these crowding agents is required for a realistic description, because they influence the overall stability of proteins, preference of more compact conformations, enzyme kinetics, etc. We will focus on three enzymes: yeast alcohol dehydrogenase and glutamate dehydrogenase, whose activities are influenced by crowding, and citrate synthase because of its two conformations. By means of molecular simulations, we will study these enzymes in aqueous solutions of dextran, polyethylene glycol, and other crowding agents. The results of the study and their critical comparison with experimental data will provide a deeper understanding of the effects of crowding agents on the structure, stability, and activity of these enzymes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10610 - Biophysics

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

BO - Biofyzika

Zahájení řešení

1. 4. 2021

Ukončení řešení

31. 3. 2024

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

29. 2. 2024

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

12. 3. 2025

Celkové uznané náklady

5 651 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 651 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč