Zobrazovení dynamiky mikrotubulů pomocí interferometrické detekce rozptýleného světla s megahertzovým rozlišením
Cíle projektu
Mikrotubuly jsou biopolymery složené z proteinu tubulinu charakterizované neustálým stochastickým přechodem mezi fázemi polymerace a depolymerace. Elektronové mikrografy naznačují, že během depolymerace mikrotubulů dochází ke strukturální změnám při kterých se konformace protofilamentů mění z napřímených segmentů do zakřivených. Tyto strukturální změny však nebyly nikdy pozorovány v dynamických vzorcích. V tomto projektu využijeme rozptylové značky k trasování strukturních změn spojených s rozpadajícími-se mikrotubuly s bezprecedentním časoprostorovým rozlišením. Naše předběžné data ukazují fluktuující character geometrie depolymerujících protofilamentů a nabízejí stochastické vysvětlení mechanismu přepínání mezi depolymerací a polymerací. Zaměříme se proto na opbjasnění tohoto procesu známého jako “microtubule rescue” a nabídneme vhled do základních mechanistických procesů probíhajících v buňkách.
Klíčová slova
bio-polymersprotein dynamicsmicrotubulesdynamic instabilityconformational changesnanoscopyinterferometric detection of scatteringiSCAT microscopy
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202200004
Hlavní účastníci
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
22-11753S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Megahertz Imaging of Microtubule Dynamics by Interferometric Scattering Microscopy
Anotace anglicky
Microtubules are cytoskeletal polymers composed of tubulin subunits that reversibly assemble into hollow tubes, alternating between periods of assembly and disassembly. During microtubule disassembly, electron micrographs suggest structural transitions from straight into curved protofilaments at the very tips of disassembling microtubules. However, these transitions of the structure have never been observed in live samples that were not fixed beforehand. Here, employing scattering labels enabling tracking of single-protofilament depolymerization trajectories, we use interferometric scattering microscopy to detect transient structural changes in the disassembling microtubule tips at unprecedented temporal resolution. Our preliminary data reveals transient fluctuations of the protofilament positions, suggesting a stochastic mechanism of switching from the disassembly to the assembly phase. We aim to elucidate the switching from disassembly to assembly, termed ‘rescue’, and provide mechanistic insight into microtubule-dependent processes in cell biology.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10306 - Optics (including laser optics and quantum optics)
OECD FORD - vedlejší obor
10610 - Biophysics
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)BH - Optika, masery a lasery
BO - Biofyzika
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 4. 2022
Ukončení řešení
31. 12. 2024
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
29. 2. 2024
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
12. 3. 2025
Finance
Celkové uznané náklady
9 534 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
9 534 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
9 534 tis. Kč
Statní podpora
9 534 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Optics (including laser optics and quantum optics)
Doba řešení
01. 04. 2022 - 31. 12. 2024