Interpretace geochemických dat magmatických hornin: použití jazyka R k vývoji nových a integraci existujících freewareových nástrojů
Cíle projektu
Nové přístupy a softwarové nástroje budou vyvinuty pro grafickou prezentaci, přepočty a modelování geochemických dat v jazyce R. Důraz bude na „P–T zohledňující“ modely parciálního tavení a magmatické diferenciace, predikující složení taveniny jako funkce složení zdroje a měnících se termodynamických podmínek. Jako vstup poslouží data hlavních prvků a proporce fází spočtené termodynamickým softwarem MELTS a Perple_X, jež budou doplněny a data stopových prvků a kvalitní grafický výstup. Kromě toho bude uvolněn komplexní balík pro přepočet minerálních dat a konvenční modelování magmatických procesů, např. tavení, krystalizace nebo hybridizace/asimilace. Výsledkem bude integrace většiny existujícího svobodného software pro interpretaci dat z magmatických hornin na jednotné platformě na bázi jazyka R, programovatelnou skripty, včetně Pythonem-hnaných notebooků (např. Jupyter). To by mělo vést k usnadnění a zlepšení interpretace a vizualizace geochemických dat (reálných i modelových), zvýšené interoperabilitě existujícího software, jakož i větší reprodukovatelnosti výzkumu.
Klíčová slova
magmatic rocksgeochemistrysoftwareR languagePythonthermodynamic modellingpartial meltingfractional crystallizationbinary mixingmajor elementstrace elementsisotopes
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202200004
Hlavní účastníci
Česká geologická služba
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
22-34175S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Interpreting geochemical data in igneous geochemistry: using the R language to develop new, and to integrate existing, free and open-source software
Anotace anglicky
New approaches and tools will be developed for graphical presentation, recalculation and modelling of geochemical data in R language. Emphasis is on ‘P–T aware’ models of melting and magmatic differentiation, predicting the melt’s chemistry as a function of the source composition and the evolving thermodynamic conditions. The input, major-element data and phase proportions provided by MELTS and Perple_X thermodynamic software, will be enriched by trace-element data and high-level graphics. Besides that will be released comprehensive software for recalculation of mineral data obtained by microbeam techniques and conventional modelling of magmatic processes such as melting, crystallization and mixing/assimilation. All these efforts shall allow closer integration of many of the existing freeware into a single R environment that can be scripted, inter alia, via Jupyter-style Python-driven notebooks. This will lead to easier recalculation and visualization of geochemical datasets (both real and modelled), enable/improve interoperability, and increase reproducibility of the research.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10505 - Geology
OECD FORD - vedlejší obor
10507 - Volcanology
OECD FORD - další vedlejší obor
10504 - Mineralogy
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)DB - Geologie a mineralogie
DC - Seismologie, vulkanologie a struktura Země
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2022
Ukončení řešení
31. 12. 2024
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
29. 2. 2024
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
12. 3. 2025
Finance
Celkové uznané náklady
2 266 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 266 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
2 266 tis. Kč
Statní podpora
2 266 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Geology
Doba řešení
01. 01. 2022 - 31. 12. 2024