Objasnění metastatického potenciálu kolorektálního karcinomu pomocí celoexomového sekvenování a profilu imunitních buněk a telomer

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202300001

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

23-05609S

Název projektu anglicky

Explaining metastatic potential of colorectal cancer through whole-exome sequening and immune cell and telomere landscape

Anotace anglicky

The project uses an internationally unique set of colorectal cancer (CRC) samples (N=100) with liver metasta-ses from the same patients to carry out whole exome sequencing (WES). We search for critical mutations and mutation signatures that are associated with the metastatic process. Numbers of mutations (tumor mutation burden) is also assessed as it is related to activation of anti-tumor immune cells. We have a possibility to di-rectly test this in an ongoing project on the same CRC samples for which densities of relevant immune cells are determined. Telomere biology is impaired in most cancers and telomere shortening will be measured. Our sample set of primary-metastasis pairs from the same CRC patients with detailed clinical data allow powerful analysis of mutations, mutation signatures and tumor mutation burden and shed light on the genetic origins of metastases. The study is also novel in being able to extend tumor-related mutations to immune cell content in tumor microenvironment, both of which may be critical determinants of patient outcome.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

30204 - Oncology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

FD - Onkologie a hematologie

Zahájení řešení

1. 1. 2023

Ukončení řešení

31. 12. 2025

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

24. 4. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

19. 2. 2024

Celkové uznané náklady

12 152 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

12 152 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč