Dynamika a údržba genomů v jednoduchých a homogenních přirozených komunitách prokaryot

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202300001

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

23-06568S

Název projektu anglicky

Genome dynamics and maintenance in simple and homogeneous natural prokaryotic communities

Anotace anglicky

Simple and spatially and genetically clearly defined microbial populations represent an optimal model for the study of prokaryotic population genetics. The bacterium Ferrovum myxofaciens from mine biostalactites perfectly meets these criteria. Our previous research has shown that the F. myxofaciens genomes have almost identical gene content but there is significant intrapopulation variability in the distribution of mobile elements and short polymorphisms. This variability probably serves for life strategy diversification or adaptation to different microniches. In this project, we propose to analyze a larger number of better characterized populations from multiple localities which will allow a functional interpretation of their variability. The influence of different genetic variants on the biological properties of F. myxofaciens will be verified on pure cultures derived from natural populations. These analyses may provide new insights into the function of mobile elements and the role of local disruptions of intraspecific gene flow in the formation of prokaryotic populations.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10606 - Microbiology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EE - Mikrobiologie, virologie

Zahájení řešení

1. 1. 2023

Ukončení řešení

31. 12. 2025

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

4. 5. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

19. 2. 2024

Celkové uznané náklady

13 260 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

12 791 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

392 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

77 tis. Kč