Vývoj deoxyribozymových senzorů generujících fluorescentní a barevné produkty

Název projektu anglicky
Development of fluorescent and chromogenic deoxyribozyme sensors
Anotace anglicky
We recently developed a deoxyribozyme that generates light by transferring a phosphate group from the 1,2-dioxetane substrate CDP-Star to itself. CDP-Star is part of a larger family of substrates that generate chemiluminescent, fluorescent, or chromogenic signals when they are dephosphorylated. Here we will use artificial evolution and high-throughput sequencing to isolate and optimize deoxyribozymes that use additional substrates from this family. Rational design will be utilized to generate variants that only generate signals in the presence of specific protein enzymes, and these sensors will be used to identify inhibitors in high-throughput screens. We will also investigate the extent to which the large datasets generated in these selections can be used in combination with machine learning to develop models that can rationalize and predict mutational effects. These new deoxyribozymes should be useful for diverse applications, including as signaling components of sensors, as novel reagents for imaging, and in multiplex assays.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
15. 2. 2024

Podobné projekty(10)