Časově rozlišená vibrační spektroskopie proteinů za užití geneticky kódovaných nekanonických aminokyselin
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202400001
Hlavní účastníci
Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
24-11819S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Time-resolved vibrational spectroscopy of proteins assisted by genetically encoded non-canonical amino acids
Anotace anglicky
Time-resolved Raman and infrared spectroscopies can provide kinetic and structural information down to the femtoseconds time scale. However, two features hinder a broader application of transient vibrational spectroscopy in protein biophysics. First, overlapping bands typically prevent selective investigation of native protein bonds. Second, the use of UV/Visible laser pulses to excite a chromophore and start a reaction severely limits the number of target systems. Here we propose a universal strategy to initiate and monitor non-equilibrium protein structural dynamics based on genetically encoded non-canonical amino acids (ncAA). We will incorporate novel ncAA carrying frequency-resolved tags, which report on local changes in hydrogen bonding and electric fields, and novel photoresponsive ncAA, which trigger changes in protein folding and binding affinity by light. The developed methods will help to unveil signal propagation pathways in the transcription factor EL222, and interaction mechanisms between interleukin-24 and its receptors.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10610 - Biophysics
OECD FORD - vedlejší obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - další vedlejší obor
10609 - Biochemical research methods
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
BO - Biofyzika<br>CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2024
Ukončení řešení
31. 12. 2026
Poslední stav řešení
B - Běžící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
27. 2. 2024
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
21. 2. 2025
Finance
Celkové uznané náklady
8 160 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
8 160 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč