Stanovení evoluce funkcí střevních mikroorganismů termitů z tisíců kompletních prokaryotických genomů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202400001

Hlavní účastníci

Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

24-12674S

Název projektu anglicky

Inferring the functional evolution of the termite gut microbiota using thousands of complete prokaryotic genomes

Anotace anglicky

Termites host diverse communities of gut microbes that digest the organic matter in the wood or the soil. While the taxonomy and function of gut prokaryote communities are known in many termites, functions have rarely been linked to specific strains. The lack of complete prokaryotic genomes has limited our ability to study the evolution of termite gut microbes. We propose to use PacBio HiFi reads and a novel phylogenetic binning strategy to generate thousands of full prokaryotic genomes derived from the gut of 50 species representative of the taxonomic and ecological diversity of termites. In addition to determining the metabolic capabilities of all prokaryotic strains endemic to termite guts, we will study their functional evolution, determining the evolution of their metabolic capabilities, the extent of horizontal gene transfers, and the effect of the host diet and endosymbiotic lifestyle on their metabolic capabilities. Our results will shed light on the evolution of the termite gut microbiota with unprecedented precision.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2024

Ukončení řešení

31. 12. 2026

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

22. 2. 2024

Celkové uznané náklady

10 593 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

10 593 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč