Objevování nových drah regulace genové exprese malými RNA v rostlinách
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202400001
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
24-12869S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Discovering new pathways for the regulation of gene expression by small RNAs in plants
Anotace anglicky
Small RNAs (sRNAs) are crucial regulators of gene expression in development, antiviral defence and adaptation to changing environment. They are known to repress expression posttranscriptionally or induce DNA methylation that blocks transcription. Our project tests the hypothesis that sRNAs also act in the RNA Polymerase II complex where they may co-transcriptionally affect pre-mRNA processing or chromatin labelling. A hot candidate for mediating these non-canonical sRNA actions is SPT6L, an essential transcription factor of Pol II with histone chaperone activity. SPT6L may also be the missing link in de novo methylation of naïve loci by recruiting plant-specific RNA Pol V. In our research on SPT6L, we managed to abolish its interaction with sRNAs, and this targeted mutation led to early flowering in Arabidopsis. Analyses of associated transcriptome and chromatin changes and identification of SPT6L protein interactors should unravel the mechanisms of the novel sRNA regulatory pathways. Our results will increase the knowledge of gene expression which may be biotechnologically relevant.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10601 - Cell biology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EA - Morfologické obory a cytologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2024
Ukončení řešení
31. 12. 2026
Poslední stav řešení
Z - Začínající víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
18. 3. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
7 148 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
7 148 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč