Strojové učení a kvantová chemie pro biomolekuly v roztoku

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202500001

Hlavní účastníci

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

25-16109S

Název projektu anglicky

Machine-learning enhanced quantum chemistry for biomolecules in solution

Anotace anglicky

The description of biomolecules using computational chemistry methods also requires the modeling of their native aqueous environment. We have already demonstrated the advantages of using semiempirical quantum-mechanical methods to calculate protein-ligand interactions, which has important applications in computer-aided drug design. The development of these methods has mainly focused on the description of gas-phase properties, and the accuracy of these methods in applications to solvated systems is now mainly limited by the solvent model. Here we propose a way to overcome the current limitations by combining a better physical model of the solvent with a machine learning correction parameterized on accurate reference data to be generated. The resulting method should establish the new state of the art in fast but accurate quantum-mechanical calculations of biomolecular systems with thousands of atoms, and we will demonstrate its applicability in a computer-aided drug design workflow.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10403 - Physical chemistry

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

Zahájení řešení

1. 1. 2025

Ukončení řešení

31. 12. 2027

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

6. 3. 2025

Celkové uznané náklady

6 549 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 126 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

423 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč