Mito-nuclear co-evolution and its consequences for species identification by DNA barcoding
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202600001
Hlavní účastníci
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
26-23521S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Mito-nuclear co-evolution and its consequences for species identification by DNA barcoding
Anotace anglicky
The close link between products of mitochondrial (mt) and nuclear (N-mt) genes functioning in mitochondria is a basis of the so-called mito-nuclear compatibility species concept and species identification based on mtDNA barcoding. In this project we will use unprecedented genomic data on African small mammals (mainly murid rodents, but not only) to test the predictions derived from the co-evolution between mtDNA and N-mt genes. Specifically, we will analyse the type of selection working on genes involved in crucial processes in mitochondria (e.g. oxidative phosphorylation) and we will review the cases and circumstances of interspecific mtDNA introgression. In selected examples, we will study in more details the level of co-introgression of N-mt genes. Finally, we plan to produce new genomic data from selected taxa and analyse the evolution of NUMTs (= nuclear copies of mtDNA fragments). All these steps should significantly improve the reliability of using mtDNA barcodes in simple species identification.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10613 - Zoology
OECD FORD - vedlejší obor
10619 - Biodiversity conservation
OECD FORD - další vedlejší obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EB - Genetika a molekulární biologie<br>EG - Zoologie<br>EH - Ekologie – společenstva
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2026
Ukončení řešení
31. 12. 2028
Poslední stav řešení
Z - Začínající víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP26-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
30. 4. 2026
Finance
Celkové uznané náklady
10 842 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
10 842 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč