Identifikace a analýza skupin konzervovaných syntenních genů bioinformatickými a molekulárně genetickými metodami

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

301/05/0738

Název projektu anglicky

Identification and analysis of groups of conserved syntenic genes by methods of bioinformatics and molecular genetics

Anotace anglicky

The proposal of this project is an extension of two successfull grant projects. It is based on the discovery made in our laboratory of genes unrelated by function and sequence, which map to a single chromosome in mammals and invertebrates, and even in unicellular eukaryotes. This arrangement of genes is called conserved synteny. The object is to perform a large scale search of eukaryotic genomes to find new syntenies and the reasons for their existence. The object will be accomplished in two steps. Inthe 1st step, new significant syntenies conserved in a smaller number of well-characterized genomes (such as human, Drosophila, C. elegans, S. cerevisiae) will be identified by whole-genome database searches. In the 2nd step, the most significant syntenieswill be evaluated by testing other genomes. In the third step, common features of the syntenic genes and the regions containing the genes will be analyzed by various bioinformatic and molecular biology methods and compared to the analyses of

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem tohoto projektu bylo analyzovat ve velkém měřítku genomy velmi vzdálených eukaryot, najít geny, které mapují na stejný chromozom u dvou či více těchto eukaryot (konzervované syntenie, zkráceně KS), a zkoumat příčiny jejich existence. Použili jsme s

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

31. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 5. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-GA0-GA-U/04:3

Datum dodání záznamu

16. 12. 2008

Celkové uznané náklady

1 863 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 863 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč