Funkční genomika jaderných receptorů Caenorhabditis elegans

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

301/05/0859

Název projektu anglicky

Functional genomics of nuclear hormone receptors in Caenorhabditis elegans

Anotace anglicky

Nuclear hormone receptors (NHRs) are transcription factors that regulate metabolism and development of metazoan species. Some members of NHR superfamily are regulated by ligands, small hydrophobic molecules such as retinoids, farnesoids, and steroids while other receptors, for which the ligands are not known yet, are called orphan receptors. In Caenorhabditis elegans, this gene family is unexpectedly large and comprises more than 280 genes. This number far exceeds NHRs found in mammalian or Drosophila melanogaster genomes. We have characterized the developmental function of CHR3 (NHR-23), a NHR that is related to Drosophila DHR3 and mammalian ROR/RZR. In search for NHRs that regulate development in C. elegans, we have uncovered functions oftwo other receptors: NHR-40 and NHR-60. Both receptors fall into a subgroup of C. elegans NHRs, characterized by a P-box CNGCKT. NHR-60 is functionally downstream of CHR3 (NHR-23) in seam cells and surprisingly, is localized at the nuclear periphery. Its

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EA - Morfologické obory a cytologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem projektu bylo přispět k porozumění regulační úlohy jaderných receptorů (NHRs) u nematoidních druhů. Plánovali jsme charakterizovat podskupinu jaderných receptorů určených sekvencí CNGCKT v oblasti nazývané P box a studovat geny v genovém shluku R07

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

31. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 5. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-GA0-GA-U/04:3

Datum dodání záznamu

16. 12. 2008

Celkové uznané náklady

4 856 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 856 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč