Odkrytí regulačních sítí na nových myších modelech metodou genetické genomiky

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

301/07/1264

Název projektu anglicky

Uncovering regulatory networks in novel mouse models by genetical genomics

Anotace anglicky

As a first step in a genome-wide analysis of genetic regulatory processes, we propose to carry out a genetical genomics analysis of gene expression in mouse brain. Using a set of C57BL/6-ChrPWD mouse inter-species chromosome substitution strains as modelorganisms and Affymetrix and Illumina oligonucleotide arrays for expression profiling, we will generate 21 catalogues of differentially regulated, brain expressed genes. Each catalogue will comprise genes whose differential transcript levels are regulated from one particular chromosome (Catalogue No.1 will contain genes regulated from Chromosome 1, and so on). Additional two catalogues will be prepared comprising: (1) the brain-expressed, sex-biased genes and (2) nuclear genes whose expression is modified by the presence of PWD mitochondrion in the C57BL/6-mitPWD conplastic strain. After verification of heritability of transcript levels, a subset of differentially expressed genes will be analysed by qRT PCR on segregating populations to obtain

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu odpovídá navrženým cílům a rovněž ekonomická část projektu je v souladu se schválenou strukturou. Vzhledem k finanční náročnosti grantu a velikosti řešitelského kolektivu rozhodla OK hodnotit grant jako splněný s výhradou přesto, že byla?

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

22. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-GA0-GA-U/02:2

Datum dodání záznamu

22. 1. 2015

Celkové uznané náklady

8 860 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 860 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč