Identifikace molekulární struktury vazebného místa pro ligand na melatoninovém receptoru MT2

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Identification of the molecular structure of ligand binding site of melatonin receptor MT2

Anotace anglicky

There is growing evidence demonstrating the complexity of melatonin's role in modulating a diverse number of physiological processes including adaptation to light intensity, blood pressure regulation, oncogenesis etc. This complexity could be attributedto the fact that melatonin receptors belong to two distinct classes of proteins, the G-protein coupled receptor family MT and MT, high- affinity melatonin binding like receptor. The amino acid sequences of these receptors show that they belong to the seven- transmembrane domain (7TM) receptor superfamily coupled to G-proteins, rhodopsin-like group of receptors. Little is known which amino acids residue of the transmembranes domains participate in high affinity melatonin binding site of MT1 and MT2. Themolecular model of MT2 is constructed by homology modeling with program ICM from the structure of rhodopsin as a template. The model then serves as the workhorse for computational ligand docking as well as for experimental studies by means of

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

FH - Neurologie, neurochirurgie, neurovědy

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30103 - Neurosciences (including psychophysiology)<br>30210 - Clinical neurology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

K lepšímu porozumění mechanizmu interakcí mezi melatoninovým receptorem typu 2 hMT2 a jeho ligandy byl vytvořen homologní model hMT2 s ligandem 2 iodomelatoninem. Byly vybrány potencionální aminokyselinové zbytky (AA) v transmembránovým doménách (TM) TM3

Zahájení řešení

1. 1. 2004

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-GA0-GA-U/03:2

Datum dodání záznamu

16. 10. 2007

Celkové uznané náklady

2 929 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 929 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč