Úloha malých nekodujících RNA v regulaci genové exprese
Cíle projektu
Úkolem navrhovaného projektu je identifikovat malé nekodující RNA (ncRNA), které se podílejí v regulaci genové exprese u antibiotika produkujících bakterií rodu streptomyces a určit jejich funkci. Projekt se zaměří také na specifickou roli 6S RNA. V první části projektu budou identifikovány ncRNA jednak bioinformaticky, jednak RNomickým přístupem. Funkce identifikovaných ncRNA bude dále studována molekulárně biologickými metodami. Z časových řad exprese ncRNA a proteinů jimi regulovaných bude odvozen numerický model regulace genové exprese s účastí ncRNA. Data budou uložena na serveru laboratoře.
Klíčová slova
ncRNA, streptomycetyregulace genové expresematematické modelování
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
310/07/1009
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Regulatory role of small-noncoding RNAs in gene expression
Anotace anglicky
The goal of the proposed project is the identification of small-noncoding RNAs(ncRNAs), participating in the regulation of gene expression in antibiotic producing bacteria - streptomycetes and determination of their function. The project will also focuson the specific role of 6S RNA. In the first part of the project ncRNAs will be identified using both bioinformatics and RNomics methods. Function of identified ncRNAs will be studied using molecular biological methods. A numerical model of gene expression including ncRNA will be derived from time series of expression of ncRNAs and proteins controlled by them. The data will be stored on the server of the laboratory.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CE - Biochemie
CEP - vedlejší obor
BO - Biofyzika
CEP - další vedlejší obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10606 - Microbiology
10607 - Virology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10610 - Biophysics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Řešení projektu proběhlo výtečně, jak z hlediska odborného tak i z hlediska čerpání finančních prostředků.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2007
Ukončení řešení
31. 12. 2011
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
16. 4. 2011
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP12-GA0-GA-U/02:2
Datum dodání záznamu
2. 5. 2016
Finance
Celkové uznané náklady
6 290 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 290 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
6 290 tis. Kč
Statní podpora
6 290 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
CE - Biochemie
Doba řešení
01. 01. 2007 - 31. 12. 2011