Vývoj mikrosatelitních markerů pro len

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární biologie rostlin AV ČR

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Development of flax microsatelite markers

Anotace anglicky

Microsatellite (Simple Sequence Repeats, SSR) markers for the discrimination and identitication of flax and linseed cultivars will be developed. Cultivar-specific microsatellite markers will be generated by a) microsatellite-directed PCR (MS PCR), b) byscreening of microsatellite-enriched libraries. Research activity b) will be accomplished within the framework of international flax collaboration consortium coordinated from Canada. Within this collaboration our research team will guarantee sequencing oat least 100 clones from these libraries per year. Design and testing of PCR primer pairs from flanking regions of sequenced SSR-loci aim to development of routine PCR assay for flax cultivar identification. SSR markers from MS-PCR will be cloned and tested for informational value in order to construct cultivar-specific discriminators for routine fingerprinting assays. Fingerprinting data will be stored and processed in high-international standard environment "GelCompar" software package (investment)

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EA - Morfologické obory a cytologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem projektu byl vývoj mikrosatelitních markerů lnu. Byla optimalizována metoda ISSR-PCR pro fingerprinting lnu. Během projektu byla provedena clusterová analýza 53 odrůd lnu a byla vytvořena obohacená genomová knihovna. Řešitel výsledky a průběh řešen

Zahájení řešení

1. 1. 2000

Ukončení řešení

1. 1. 2002

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

2 063 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 585 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč