Molekulární variabilita izolátů viru Y bramboru (PVY)

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Výzkumný ústav bramborářský Havlíčkův Brod, s.r.o.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Molecular variability of Potato Virus Y (PVY) isolates

Anotace anglicky

The project proposed is aimed to characterise molecular variability of potato virus Y (PVY) in detail using combination of different methods, especially specific reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR), analysis of cDNAs by means of temperature-gradient gel electrophoresis (TGGE), restriction analysis (RFLP) and sequencing. For this purpose a representative collection of biologically and serologically characterised PVY isolates will be prepared. This complex approach enables to investigate PVY diversity and presence of virus quasispecies within individual isolates on the one hand, but on the other hand, it is assumed that specific conserved or variable PVY cDNA domains mainly within P1, NIb, CP and CI virus genes will be selected, which enable to discriminate different molecular variants and strain groups of PVY. It is assumed that new procedure for practical PVY diagnosis will be developed.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl zaměřen na studium genetické variability Y viru bramboru (PVY). Analýzou oblastí P1, HC-Pro, P3 a Nib genomu, byly objeveny geneticky variabilní populace PVY, pravděpodobně velmi významné z evolučního hlediska. Tak detailní a přesná genetická

Zahájení řešení

1. 1. 2000

Ukončení řešení

1. 1. 2002

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

4 196 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 241 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 483 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč