Analýza genetické a patogenní variability v populaci Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus molekulárními technikami

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

The use of molecular techniques for understanding of genetic and pathogenic variability in population Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus

Anotace anglicky

Potato ring rot, incited by Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (Cms) poses a threat for potato growing. It causes wilting and dying of plants and secondary rooting of tubers. Cms is considered of quarantine significance throughout the world. Specific quarantine requirements for Cms involve laboratory testing for latent infection using method set out in Council Directive EEC (1993). The primary purpose of the project is to analyse variability in virulence of Cms isolates. Fluidic and nonfluidicCms colony forms will be used as model objects for the study of changes in genetic and pathogenic characteristics of ring rot bacteria. An attempt will be made to determine the genetic origin in shifting of Cms colony forms using random priminPCR methods. The unique amplified products characteristic for each Cms phenotype, will be sequenced finally. The inoculation methods will be improved with the aim to shorten test of pathogenicity. The testing of latent infection will be improved by PCR

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

CEP - vedlejší obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl zaměřen na stanovení genetické, imunochemické, biochemické a patogenní variability u fluidních a nefluidních forem původce bakteriální kroužkovitosti bramboru Clavibacter michiganensis subsp.sepedonicus (Cms). V průběhu řešení projektu bylo

Zahájení řešení

1. 1. 2000

Ukončení řešení

1. 1. 2002

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

4 050 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 103 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 207 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

140 tis. Kč