Studium organizace rostlinného jaderného chromatinu
Cíle projektu
Genetická informace eukaryot je uložena v lineárních strukturách, DNA a chromozómech. Lokalizace genů na chromozomu má velký význam na genovou expresi i replikaci DNA a ostatní spojené fyziologické projevy rostlinné buňky. Tyto projevy se však uplatňujízejména v interfázi. Znalost struktury a funkci interfázního jádra je zásadním předpokladem pro porozumění růstovým a vývinovým procesům u rostlin. Během naší předchozí práce jsme vyvinuli imunocytochemické metody, kterými jsme detekovali aktivituchromatinu jednak na mitotických chromozómech, jednak v interfázních buněčných jádrech. Přinesli jsme řadu důkazů o korelaci aktivity chromatinu s časnou replikací chromozómových oblastí bohatých na geny. Vzhledem k tomu, že rostliny s různě velkýmigenomy mají irůznou základní strukturu uspořádání jaderného chromatinu, chceme se v předloženém projektu soustředit na komparaci dvou modelů, Arabidopsis a Silene. Budeme studovat genové lokusy a výrazné chromozómové struktury (centroméry, teloméry, eu-
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Cytogenetic study of nuclear chromatin organization in plants
Anotace anglicky
Main body of cytogenetic data in flowering plants comes from the observations on mitotic chromosomes. Linear structure of chromosomes (ordered arrangement of genes, heterochromatin domains, location of prominent chromosomal structures as telomeres andcentomeres) has substantial significance on gene expression and DNA replication during interphase. The knowledge of genome organisation and function is a critical point in understanding the physiologiclal processes during plant growth and development. Inourprevious work with we elaborated immunocytochemical detection of transcribed chromatin in both, mitotic chromosomes and interphase nuclei and brought some indirect evidence of the correlation of chromatin activity with early replication andlocalisationof the majority of genes. Since plants with small and large genomes have different organisation of chromatin, we propose to conduct a comparative study to follow gene loci and prominent chromosomal landmarks in both, chromosomes and
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
ED - Fyziologie
CEP - vedlejší obor
EF - Botanika
CEP - další vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
30101 - Human genetics
30105 - Physiology (including cytology)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt byl zaměřen na studium organizace rostlinného jádra. Jako modelové rostliny byly zvoleny takové druhy, které mají různou komplexitu genomů, různou organizaci jaderného chromatinu a konečně i modely polyploidní, případně hybridní. Sjednocujícím pr
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2003
Ukončení řešení
1. 1. 2005
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Datum dodání záznamu
15. 1. 2009
Finance
Celkové uznané náklady
6 924 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 226 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
3 698 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
6 924 tis. Kč
Statní podpora
3 226 tis. Kč
46%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
ED - Fyziologie
Doba řešení
01. 01. 2003 - 01. 01. 2005