Alternativní cesta degradace cytokininů
Cíle projektu
Cytokininy s aromatickým postranním řetězce, jako jsou například benzyladenin, kinetin a topoliny byly prokázány v rostlinách, ale jejich mechanismus účinku a také jejich biosyntéza a degradace nejsou dosud objasněny. Také není zcela jasné, zdali se vyskytují pouze jako součást tRNA nebo i ve volné formě. Klíčovým enzymem odbourávání cytokininů s isoprenoidním postranním řetězcem (isopentenyladenin, zeatin) je cytokinindehydrogenasa (EC1.5.99.12), který však aromatické cytokininy téměř nepřeměňuje. Další cesta jak by mohly být tyto deriváty adeninu v rostlinách metabolizovány je prostřednictvím adenindeaminasy (EC 3.5.4.2), která hydrolyticky přeměňuje adenin na hypoxantin, nebo AMP-deaminasy (EC 3.5.4.6), která přeměňuje AMP na IMP. Otěchto enzymech kterých existují literární odkazy, že byly schopné in vitro odbourávat ribosidy, respektive nukleotidy odvozené od kinetiku a benzyladeninu. V rámci projektu budou klonovány geny kódující tyto enzymy z kvasinek Saccharomyces cerevisiae a
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 9 (SGA02006GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
522/06/0022
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Alternative pathway of cytokinin catabolism
Anotace anglicky
Cytokinins bearing aromatic side-chain, such as benzyladenine, kinetin and topolins, were found in plants, but their mechanism of action and pathways of biosynthesis and degradation have not been understood. It is not clear, if these compounds exist in free from or only as modified bases in tRNA. The key enzyme in the degradation of isoprenoid cytokinins (isopentenyladenine, zeatin) is cytokinin dehydrogenase (EC 1.5.99.12). This enzyme, however, does not efficiently convert the aromatic cytokinins in in vitro experiments. Another possible pathway of catabolism of these compounds is via adenine deaminase (EC 3.5.4.2) that hydrolytically converts adenine to hypoxanthine, or AMP deaminase (EC 3.5.4.6) that converts AMP to IMP. These are few references showing that these enzymes were able to degrade in vitro ribosides, respectively nucleotides, derived from kinetin and benzyladenine. In the proposed project, genes encoding these enzymes will be cloned from Saccharomyces cerevisiae and if possible also
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
EF - Botanika
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V rámci projektu bylo provedeno klonování a funkční exprese tří genů adenin/adenosindeaminas, a to AAH1 ze Saccharomyces cerevisiae, SPBC1198.02 ze Schizosaccharomyces pombe a At4g04880 z Arabidopsis thaliana. Všechny tři enzymy kódované těmito geny byly
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2006
Ukončení řešení
31. 12. 2008
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
25. 4. 2008
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP09-GA0-GA-U/02:2
Datum dodání záznamu
22. 10. 2009
Finance
Celkové uznané náklady
3 132 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 132 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Uznané náklady
3 132 tis. Kč
Statní podpora
3 132 tis. Kč
0%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2006 - 31. 12. 2008