Sekvenování a analýza genomu viru lemování žilek jahodníku

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav molekulární biologie rostlin AV ČR

Druh soutěže

—

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Sequencing and the genome analysis of the strawberry vein banding virus

Anotace anglicky

The project will bring original knowledge about the sequence and genome arrangement of the Strawberry vein banding virus (SVBV), which is a new virus recently found in the Europe. The virus will be isolated from infected strawberry plants, where the presence of SVBV will be confirmed by S-blotting. Viral nucleic acid will be isolated and fragmented by restriction endonucleases, cloned into plasmid following standard producers and sequenced. Sequence and the genome arrangement of the SVBV will be analysed and compared with other caulimoviruses. Its sequence will be screened and specific primers for routine diagnosis of the virus by PCR will be prepared. Promoter directed the synthesis of the whole virus genome transcript will be selected from the bank of clones and used in artificial construction to control the expression of ß-glucuronidase (GUS) marker gene.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - vedlejší obor

EI - Biotechnologie a bionika

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla získána kompletní sekvence viru lemování žilek jahodníku. Nalezeny byly primery vhodné pro rutinní detekci viru pomocí PCR. Promotor viru byl začleněn do plazmidu, v němž kontroluje transkripci signálního genu beta-glukuronidázy. Charakteristika výs

Zahájení řešení

1. 1. 1996

Ukončení řešení

1. 1. 1998

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6

Datum dodání záznamu

—

Celkové uznané náklady

1 796 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 147 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč