Komparativní imunogenomika čeledi Equidae
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
523-09-1972
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Comparative immunogenomics of the family Equidae
Anotace anglicky
Comparative analysis of the immunogenome of the family Equidae in the context of host-pathogen interactions will be performed. Allelic sequence diversity, evolution and balancing selection of the MHC DRB, DQB genes and of the KIR/Ly49 genes, encoding natural killer cell receptors will be analyzed in zebras, asses and donkeys. Furthermore, comparative analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in selected immunity-related genes will be performed in various species of zebras, asses and in two populations of domestic donkeys. Genes showing across-breed associations with virus (West Nile virus), bacterial (Rhodococcus equi) and protozoan (Trypanosoma evansi) infections will be selected for analysis. Horse-specific primers will be used for amplifying the corresponding orthologues in other equid species. The PCR products will be cloned and sequenced. SNPs identified will be used for evaluating the extent of genetic diversity and evolutionary relationships of various Equids. Chromosome evolution of Equidae with special focus on chromosome microrearrangements will be investigated.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
GI - Šlechtění a plemenářství hospodářských zvířat
CEP - vedlejší obor
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
CEP - další vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40203 - Husbandry<br>40301 - Veterinary science
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Podrobné mapování imunogenomu čeledi Equidae, zároveň s celogenomovým srovnávacím mapováním některých subchromosomálních přestaveb. Asociace mezi polymorfními markery vybraných genů imunitní odpovědi a některých protozoarních parazitů. Také byly vytvoře?
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2009
Ukončení řešení
31. 12. 2012
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2012
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Datum dodání záznamu
17. 5. 2016
Finance
Celkové uznané náklady
6 886 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 886 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč