Detailní mapování QTL u prasat pomocí mikrosatelitů a kandidátních genů vybraných na základě komparativních map
Cíle projektu
Účelem projektu je přispět k mezinárodnímu úsilí, zaměřenému na detailní mapování QTL, podmiňující kvalitu masa a jatečného těla u prasat pomocí mikrosatelitů a kandidátních genů, vybraných na základě komparativních map. Úsilí bude hlavně směrováno na: 1) typování mikrosatelitů v hohenheimských rodinách za účelem detailnější lokalizace některých QTL; 2) cytogenetické mapování EST ("expressed sequence tags") izolovaných ze svalové cDNA knihovny, cytogenetické a vazbové mapování genů Typu I za účelem saturace integrované mapy prasečího genomu; 3) výběr kandidátních genů, ovlivňujících kvalitu jatečného těla a masa v chromozómových oblastech, ve kterých byla prokázána existence jednoho nebo více QTL (hledání na homologních chromosomových úsecích v lidskéa myší genomové databázi), detekci alelických variant vybraných genů, jejich typování ve třech třígeneračních hohenheimských rodinách (divoké prase x piétrain, meishan x piétrain, divoké prase x meishan) a výpočet genových efektů.
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
—
Hlavní účastníci
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Detailed mapping of QTLs in the pig by means of microsatellites and through comparative positional candidate gene approach
Anotace anglicky
The aim of the project is to contribute to international endeavour directed to detailed mapping of QTLs controlling carcass and meat quality traits by means of microsatellites and through comparative positional candidate approach. We will focus our endeavour to: i) Microsatellite typing in three three-generation F2 pedigrees prepared at Hohenheim (Wild Boar x Piétrain, Meishan x Piétrain, Wild Boar x Meishan) for more detailed localization of QTLs. ii) Cytogenetic mapping of expressed sequence tags (ESTs) isolated from muscle cDNA library and cytogenetic and linkage mapping of Type I genes to contribute to saturation of the integrated map of porcine genome. iii) Selection of candidate genes for QTLs affecting carcass and meat quality traits for chromosome region(s) to which significant QTL had already been mapped (search within homologous chromosome regions in human and mouse genome databases), detection of allelic variants of the genes, their scoring in three three-generation Hohenheim F2
Vědní obory
Kategorie VaV
—
CEP - hlavní obor
GI - Šlechtění a plemenářství hospodářských zvířat
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
40203 - Husbandry
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Při řešení projektu byly získány následující výsledky. Byl lokalizován QTL pro množství tuku na chromozomu X. Řešitel spolupracoval na lokalizaci QTL pro růst a množství tuku na chromozomu 4. Řešitelský kolektiv lokalizoval cytogenetickými metodami geny
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 1999
Ukončení řešení
1. 1. 2001
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3
Datum dodání záznamu
1. 4. 2003
Finance
Celkové uznané náklady
4 039 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 377 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 718 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
4 039 tis. Kč
Statní podpora
3 377 tis. Kč
83%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
GI - Šlechtění a plemenářství hospodářských zvířat
Doba řešení
01. 01. 1999 - 01. 01. 2001