Mapování pozic inzerční sekvence IS901 v genomu kmenů Mycobacterium avium subsp. avium

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)

Hlavní účastníci

Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Mapping of the insertion element IS901 positions in the genome of Mycobacterium avium subsp. avium

Anotace anglicky

Avian tuberculosis caused by Mycobacterium avium subsp. avium strains is a serious disease of birds and other vertebrates including human beings. The importance of the study of these mycobacterial species started to increse in recent years especially asthe strains cause 50-60% of opportunic infection in AIDS patients. Despite an intensive research in this field during the last years, the genetic basis of the pathogenicity remains poorly understood. It was reported that the presence of IS901 in themycobacterial strains is associated with their virulency for birds. It is supposed, from the experiments on mice and chicken, that IS901 can enhance virulence of M. avium strains. The aims of the study is mapping sites of insertion of IS901 nad findingout genes which can contribute to virulence. As IS901 is a transposable element, which can after insertion to coding sequence change or disrupt expression of adjacent genes (position effect). The gene expression can also be influenced by replacement of

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina

CEP - vedlejší obor

FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases<br>40301 - Veterinary science

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Souhrn výsledků řešení projektu V tomto projektu bylo zmapováno 13 pozic (26 lokusů) inzerčního elementu IS901 v chromozómu M. a. avium kmene 2889, byly identifikovány sousedící geny a byla vytvořena fyzikální mapa u 25 různých RFLP typů na bázi restrikč

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-GA0-GA-U/07:6

Datum dodání záznamu

15. 1. 2009

Celkové uznané náklady

3 030 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 430 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

600 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč