MHC třída IIB genů evropských kaprovitých ryb: jejich genetická variabilita a evoluce ve vztahu k životní strategii hostitelů a parazitismu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

MHC class IIB genes of European cyprinid fish: their genetic variability and evolution in relation to the host life-history traits and parasitism

Anotace anglicky

Analyses of the major histocompatibility complex genes (MHC) have been part of projects concerning not only the immune response of organisms to presence of pathogen. The MHC presents a group of genes of the highly polymorphic loci encoding the proteins that bind a peptide fragment derived from the foreign antigen and stimulate an immune response. Recently, the factors driving and maintaining the extensive MHC polymorphism have been questioned. The pathogen-driven balancing selection and MHC-dependent mating preferences leading to increase the offspring resistance present two non-contradictious hypotheses used to explain the great variability of MHC genes. However, the support for the pathogen-mediated selection is still limited and indirect. The aimsofthe project will be to investigate the allelic variability of MHC class IIB genes in large range of cyprinid fish belonging to four subfamilies and phylogenetic analyses inferred from the exon 2 and 3. Using the different molecular methods permits to

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EC - Imunologie

CEP - další vedlejší obor

EG - Zoologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics<br>30102 - Immunology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Variabilita a polymorfizmus genů DAB třídy MHC IIB byly analyzovány u kaprovitých ryb, zástupců různých podčeledí. Potvrzen byl vliv pozitivní selekce u sekvencí exonu 2 potenciálně zprostředkované parazity nebo patogeny, a negativní selekci u exonu 3. A

Zahájení řešení

1. 1. 2004

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-GA0-GA-U/03:2

Datum dodání záznamu

16. 10. 2007

Celkové uznané náklady

3 451 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 951 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

750 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč